影片背景設置在11世紀的波斯，一位英國人爲了學習醫術掩蓋其天主教徒的身體，加入了伊斯巴罕一所只招收猶太人的醫學院。他治隨的老師名叫阿維森納，是歷史上著名的猶太科學家、思想家和醫生。阿維森納的著作達200多種，最著名的有《哲學、科學大全》，在當時是高水平的百科全書；另一部 鉅著是《醫典》，直到17世紀西方國家還視爲醫學經典，至今仍有參考價值。《神醫》結合史詩與虛構，展現了在那個被愚昧和迷信統治的世紀裏一羣人探索真知的無畏精神。